До начала Великой Отечественной войны Василий Шипилов работал пилотом Северо-Казахстанского управления Гражданского воздушного флота, а затем — Саратовского авиаотряда специального применения.

В составе действующей армии был с августа 1941 года.

География подвигов:
-Боевые вылеты на Западном фронте;
-Перегон новых самолетов с авиационного завода в Комсомольске-на-Амуре
на фронт;
-Снабжение югославских партизан и войск Народно-освободительной армии Югославии (НОАЮ):
совершил 138 боевых вылетов, из которых 83 – в ночное время. Бойцам НОАЮ и партизанам летчик доставил около 140 тонн оружия и боеприпасов. Вывез 262 раненых.

За образцовое выполнение боевых заданий и проявленные при этом отвагу и геройство 29 июня 1945 года летчику присвоено звание Героя Советского Союза.

После войны Василий Шипилов вернулся в гражданскую авиацию: был командиром воздушного судна, работал в аэропорту.